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研究背景

泛癌分析可以通过分析各种类型癌症的分子异常来阐明人类恶性肿瘤的共同特征和异质性。TCGA项目和GEO数据库包含不同肿瘤的功能基因组数据集，从而进行泛癌分析。因此，泛癌分析有助于联合疗法和个体化疗法的发展，以将治疗应用于各种癌症模型。研究表明，PCNA钳夹相关因子(PCLAF)在多种癌症中起着至关重要的作用；然而，PCLAF在癌症中的表达谱和具体分子机制尚不清楚，其在人类泛癌症分析中的价值也不清楚。

文献来源

近日，上海交通大学新华医院武志祥课题组在International Journal of Oncology 发表研究性论文“Pan‑cancer analyses reveal the regulation and clinical outcome association of PCLAF in human tumors” ，研究发现与正常组织相比，PCLAF在癌症组织中高表达与预后不良显著相关，并且PCLAF的表达与活化的CD4 T细胞(Act CD4)和2型T辅助细胞(Th2)呈正相关，表明PCLAF可能在肿瘤免疫浸润中发挥特殊作用，此外PCLAF的功能机制还涉及有丝分裂细胞周期过程、细胞分裂和DNA复制。

人类PCLAF在不同癌症类型中以及不同病理分期时的表达水平

研究者对PCLAF在不同细胞和非肿瘤组织中的表达模式进行了研究，研究发现PCLAF在大多数癌症类型中的表达显著升高，如膀胱、脑和中枢神经系统(CNS)、乳腺癌等，并且使用病理分期图模块评估后，作者发现PCLAF的表达随着临床分期从I期到IV期的增加而增加；

PCLAF表达与TME（肿瘤微环境）的相关性分析

随着肿瘤分子生物学和相关学科的蓬勃发展，肿瘤浸润免疫细胞作为肿瘤微环境的重要组成部分，与恶性肿瘤的发生、进展和转移密切相关，作者通过TIMER,CIBERSORT,CIBERSORT‑abs,QUANTISEQ等算法探究了肿瘤免疫浸润与PCLAF基因表达之间的潜在关系，结果发现PCLAF的表达与癌症相关成纤维细胞的估计浸润值呈统计学上的正相关，相反，PCLAF在BRCA,COAD,HNSC,STAD,THYM和TGCT中呈负相关。

肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)水平可以作为前哨淋巴结状态和癌症生存率的独立预测指标，作者在TISDB数据库中评估了PCLAF表达与28个TIL之间的相关性。在TISDB数据库的疾病中，PCLAF的表达与活化的CD4 T细胞(Act-CD4)和2型辅助T细胞(Th2)呈正相关。以上这些数据表明PCLAF可能在肿瘤免疫浸润中发挥特定作用。

PCLAF可促进HepG2细胞增殖，抑制细胞凋亡

为进一步阐明PCLAF基因在肿瘤中的潜在分子机制，作者通过进行一系列途径的富集分析来筛选靶向的PCLAF结合蛋白和PCLAF表达相关基因，利用STRING数据库与GEPIA2工具锁定了36个基因，通过分析Metascape中的GO和KEGG，预测了36个基因的功能。发现这些基因主要富集在“有丝分裂细胞周期过程”“细胞分裂”“细胞核周期”和“DNA复制”中。

于是作者构建了PCLAF-shRNA肝癌细胞稳定株，并在确认干扰效率的情况下进行相关验证试验，研究发现，PCLAF可以促进多种癌细胞的增殖和DNA合成，从而促进癌症的发展。此外PCLAF还可以通过调节免疫细胞的浸润和细胞周期的调控等机制影响癌症的发展。